Die Erde steht kurz vor der Zerstörung und ein Großteil davon brennt bereits. Irgendwo da draußen, in dem, was wir bisher als "Unbekannter Raum" bezeichnet haben, existiert eine außerirdische Rasse, deren Ziel es ist, alles zu zerstören, was von unserer Welt übrig geblieben ist.

Du bist Commander Shepard und der einzige Weg, das zurückzuerobern, was den Erdlingen gehört, besteht darin, alle Rassen zu sammeln, zusammenzuarbeiten und eine letzte Mission auszuführen, um den Feind zu vernichten. Ob du erfolgreich sein wirst, liegt in deinen Händen. Die Erde brennt, schaffst du es rechtzeitig?