Година 1204 г .: Войската на Четвъртия кръстоносен поход, които са нахлули във Византийската империя, заемат и обират Константинопол. Гърция се разделя: в Егейския регион се формират нови гръцки, франкски и венециански държави. Три години по-късно разнообразна група авантюристи, водена от венецианеца Марко Санудо, завладява Наксос, както и други острови в Кикладите.
Оттогава островът Ариадна ще стане столица на Херцогството на Егейско море или Архипелага. Венецианците ще управляват Наксос около три и половина века, установявайки феодална система, която ще продължи до началото на 19 век. В резултат на това властта на техните потомци върху местното население фактически ще се запази дори след завладяването на острова от турците.
През този период Наксос ще бъде цел във венециано-турската конкуренция за владение в Егейско море, докато пристигането и дейността на главно френски мисионери на острова с толерантността на османците ще засилят вече силното западно присъствие в Кикладите по време на османското владичество.
Паметниците, оставени от завоевателите, ще останат мълчаливи свидетели на латинското присъствие и господство в Наксос: Крепостта на Хора и разпръснатите кули по целия остров.